ชื่อภาพ

เทคโนโลยีทางการแพทย์ Huaren

บริการด้านการวิจัยและพัฒนา

ชื่อภาพ

บริการวิเคราะห์ลำดับ

211

 

huaren

 

• บริการวิเคราะห์ลำดับเบส

 

การจัดลำดับจีโนมแบบเซลล์เดียว 10xGenomics

การวิเคราะห์การแสดงออกของยีนความละเอียดสูงในระดับเซลล์เดียว การวิเคราะห์เชิงลึกของประชากรเซลล์ที่ซับซ้อน การระบุลักษณะโปรไฟล์การแสดงออกของเซลล์แต่ละเซลล์; การรบกวน CRISPR โปรตีนผิวเซลล์สามารถตรวจพบได้พร้อมกัน หลีกเลี่ยงข้อมูลทางชีวภาพที่แตกต่างกันของเซลล์แต่ละเซลล์ที่จะถูกปิดบังโดยการทำให้เป็นเนื้อเดียวกันของเซลล์จำนวนมาก

 

 

• บริการวิจัยระดับจีโนม

 

การจัดลำดับสำหรับการระบุประชากรจุลินทรีย์ (16S/18S/ITS)

จำนวนจุลินทรีย์ในธรรมชาติมีมากมายมหาศาล และส่วนใหญ่ไม่สามารถสังเกตได้ในการเพาะเลี้ยงในห้องปฏิบัติการ จำนวนชนิดของจุลินทรีย์ที่รู้จักกันดีมีมากกว่า 100,000 ชนิด และยังคงเป็นจำนวนที่เพิ่มขึ้นอย่างรวดเร็ว การจัดลำดับดีเอ็นเอได้รับการพิสูจน์แล้วว่ามีความแม่นยำและรวดเร็วกว่าวิธีการทางชีวเคมีและการสร้างแบบจำลองแบบดั้งเดิม และสามารถใช้ได้กับเชื้อจุลินทรีย์ทุกสายพันธุ์โดยไม่คำนึงถึงลักษณะของสายพันธุ์นั้นๆ ด้วยเครื่องมือการจัดลำดับขั้นสูงและประสบการณ์การทดสอบจุลินทรีย์หลายปี เราสามารถให้บริการการทดสอบจุลินทรีย์ที่รวดเร็ว มีประสิทธิภาพ และน่าเชื่อถือแก่คุณ รวมถึงการจัดลำดับดีเอ็นเอแบคทีเรีย 16SrDNA การจัดลำดับดีเอ็นเอเชื้อรา 18SrDNA และการจัดลำดับ ITS

 

• บริการวิจัยการจัดลำดับทรานสคริปโตม

 

การจัดลำดับ lncRNA

Long-noncoding RNA (lncRNA) เป็นโมเลกุล RNA ที่มีความยาวระหว่าง 200 ถึง 100,000 nt ซึ่งไม่มีหน้าที่ในการเข้ารหัสโปรตีน พวกมันมีอยู่ในทั้งรูปแบบที่มีหาง polyA และไม่มีหาง polyA และมีลักษณะเด่นคือการอนุรักษ์ข้ามสายพันธุ์ต่ำ การแสดงออกเฉพาะเนื้อเยื่อ และความอุดมสมบูรณ์ต่ำ lncRNAs มีความหลากหลายมากกว่า RNA ที่เข้ารหัส และมีการประมาณการอย่างอนุรักษ์นิยมว่า 4%-9% ของลำดับจีโนมของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมสร้างทรานสคริปต์ lncRNA ในขณะที่สัดส่วนของ RNA ที่เข้ารหัสโปรตีนที่สอดคล้องกันมีเพียง 1%-5% งานวิจัยปัจจุบันชี้ให้เห็นว่า lncRNAs มีส่วนเกี่ยวข้องในการควบคุมการถอดรหัส การควบคุมหลังการถอดรหัส การขนส่งโปรตีน และการย่อยสลาย mRNA lncRNAs กลายเป็นจุดสนใจในด้านการวิจัย RNA ที่ไม่เข้ารหัส และด้วยความช่วยเหลือของการจัดลำดับความละเอียดสูง นักวิจัยสามารถรับ lncRNAs ที่เกี่ยวข้องกับโรคหรือกระบวนการทางชีวภาพเฉพาะและทำการศึกษาเชิงลึกได้อย่างรวดเร็ว

smallRNA sequencing

SmallRNAs เป็นตัวควบคุมกิจกรรมของสิ่งมีชีวิตที่สำคัญและมีบทบาทสำคัญในการควบคุมการแสดงออกของยีน การพัฒนาทางชีวภาพ การเผาผลาญ และการเกิดโรคและกระบวนการทางสรีรวิทยาอื่นๆ รวมถึง miRNAs, piRNAs และ siRNAs

การจัดลำดับ Cyclic RNA

การจัดลำดับ Cyclic RNA เป็นเทคโนโลยีการจัดลำดับทรานสคริปโตมที่กำลังเกิดขึ้นใหม่ ในอดีตโดยทั่วไปแล้วถือว่า RNA ที่ไม่เข้ารหัสในเซลล์มีอยู่ในรูปแบบเชิงเส้นเป็นส่วนใหญ่ ในช่วงไม่กี่ปีที่ผ่านมา มีการศึกษาเพิ่มมากขึ้นเรื่อยๆ พบว่าการแสดงออกของ Cyclic RNAs ในเซลล์สัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมสูงกว่าระดับที่ได้รับการยอมรับโดยทั่วไป Cyclic RNAs สามารถมีส่วนร่วมในการควบคุมการแสดงออกของยีน เช่น การปิดบทบาทของ miRNAs และการควบคุมการแสดงออกของยีน homeodomain ซึ่งเป็นจุดสนใจในการวิจัยใหม่ในการศึกษารหัส RNA ที่ไม่เข้ารหัสสายยาว

 

• บริการวิจัยด้าน Epigenetics

นักวิจัยสามารถใช้เทคโนโลยี MeDIP-Seq และ hMeDIP-Seq เพื่อค้นหาบริเวณที่มีการมีธิเลชันบนจีโนมได้อย่างรวดเร็วและมีประสิทธิภาพ โดยเปรียบเทียบความแตกต่างในรูปแบบการปรับเปลี่ยนการมีธิเลชันของดีเอ็นเอระหว่างเซลล์ เนื้อเยื่อ หรือตัวอย่างโรคที่แตกต่างกัน และให้หลักฐานทางทฤษฎีสำหรับการศึกษาทางชีววิทยาหรือโปรโตคอลที่ใช้ในทางคลินิก

 

การจัดลำดับการมีธิเลชัน MeDIP
hrการจัดลำดับ MeDIP-Seq (Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing) เป็นเทคโนโลยีการตรวจจับการมีธิเลชันทั่วทั้งจีโนมโดยยึดตามหลักการของการเสริมความเข้มข้นของแอนติบอดีสำหรับการจัดลำดับ โดยใช้เทคโนโลยีการมีธิเลชันของดีเอ็นเอที่มีการมีธิเลชัน ผ่านแอนติบอดี 5'-methylcytosine (5mC) ที่มีความจำเพาะในการเสริมความเข้มข้นของจีโนมเกี่ยวกับการเกิดการมีธิเลชันของชิ้นส่วนดีเอ็นเอ แล้วจึงสามารถทำการศึกษาความแม่นยำสูงระดับจีโนมของบริเวณที่มีการมีธิเลชันสูงที่หนาแน่นของ CpG ได้ผ่านการจัดลำดับความละเอียดสูง

การจัดลำดับ hMeDIP-Seq (hydroxymethylcytosineDNAImmunoprecipitationSequencing) มีหลักการเดียวกันกับ MeDIP-Seq แอนติบอดี 5'-Hydroxymethylcytosine (5hmC) ถูกใช้เพื่อเสริมความเข้มข้นของชิ้นส่วนดีเอ็นเอที่มีการมีธิเลชันบนจีโนมโดยเฉพาะ 5hmC เป็นเบสตัวปรับเปลี่ยนที่ค้นพบใหม่ที่ผลิตโดยเอนไซม์ตระกูล 10-11 translocation (TET) ผ่านการออกซิเดชัน 5hmC เป็นเบสตัวปรับเปลี่ยนที่ค้นพบใหม่ที่ผลิตโดยเอนไซม์ตระกูล 10-11 translocation (TET) ผ่านการออกซิเดชันของ 5mC 5hmC ไม่เพียงแต่ลดความสัมพันธ์ของโดเมนการจับการมีธิเลชัน (MBD) ของโปรตีน MeCP สำหรับดีเอ็นเอที่มีการมีธิเลชัน ซึ่งอาจมีส่วนเกี่ยวข้องในการควบคุมการถอดรหัสการแสดงออกของยีน แต่ยังมีส่วนร่วมในกระบวนการการลบการมีธิเลชันของดีเอ็นเอ

นักวิจัยสามารถใช้เทคโนโลยี MeDIP-Seq และ hMeDIP-Seq เพื่อค้นหาบริเวณที่มีการมีธิเลชันบนจีโนมได้อย่างรวดเร็วและมีประสิทธิภาพ โดยเปรียบเทียบความแตกต่างในรูปแบบการปรับเปลี่ยนการมีธิเลชันของดีเอ็นเอระหว่างเซลล์ เนื้อเยื่อ หรือตัวอย่างโรคที่แตกต่างกัน และให้หลักฐานทางทฤษฎีสำหรับการศึกษาทางชีววิทยาหรือโปรโตคอลที่ใช้ในทางคลินิก

 

hrการจัดลำดับการมีธิเลชัน mRNA
การปรับเปลี่ยน Epigenetic เกิดขึ้นไม่เพียงแต่ในระดับจีโนม (การมีธิเลชันของดีเอ็นเอ) แต่ยังเกิดขึ้นในระดับทรานสคริปโตมและมีหน้าที่ในการควบคุมหลังการถอดรหัสที่สำคัญอยู่ภายใน ตั้งแต่เมื่อสี่สิบปีที่แล้ว มีการค้นพบว่ามีการปรับเปลี่ยนการมีธิเลชันบนอะดีนีน (m6A) บน messenger RNA การปรับเปลี่ยน m6A นี้แพร่หลายมาก เกิดขึ้นในความถี่ประมาณ 3-5 ตำแหน่ง/mRNA การปรับเปลี่ยนการมีธิเลชัน m6A เป็นแบบย้อนกลับได้และอาจถูกควบคุมอย่างไดนามิก การมีธิเลชันและการลบการมีธิเลชัน m6A ถูกควบคุมโดยคอมเพล็กซ์มีธิเลส METLE3, METLE14, WTAP และดีมีธิเลส FTO m6A ถูกอนุรักษ์ไว้เป็นอย่างดีในทรานสคริปโตมของมนุษย์และหนู ซึ่งบ่งชี้ว่าการปรับเปลี่ยนนี้น่าจะมีหน้าที่สำคัญ m6A มีความสัมพันธ์กับการตัดต่อ mRNA การควบคุมนาฬิกาชีวภาพ และความเสถียรของ mRNA นอกจากนี้ m6A ยังทำให้เกิดการเคลื่อนย้าย mRNA จากไรโบโซมที่แปลไปยัง P-body ในไซโตพลาสซึมโดยการเกณฑ์ YTHDF2 ซึ่งจะถูกย่อยสลาย และระดับการย่อยสลาย mRNA นั้นสัมพันธ์กับจำนวนตำแหน่งมีธิเลชัน

สำหรับการตรวจจับการมีธิเลชันของ mRNA ปัจจุบันใช้วิธีการเสริมความเข้มข้นของ mRNA ที่มีการมีธิเลชันรวมกับการจัดลำดับความละเอียดสูง (MeRIP-Seq, การมีธิเลชัน RNA ที่มีการมีธิเลชันเฉพาะ m6A พร้อมการจัดลำดับรุ่นต่อไป) หลักการของ MeRIP-Seq คือเนื่องจากการมีธิเลชันของ mRNA โดยทั่วไปเกิดขึ้นที่อะตอมไนโตรเจนที่ 6 ของอะดีนีนในสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม ชิ้นส่วน mRNA ที่มีการมีธิเลชันสูงสามารถเสริมความเข้มข้นได้โดยการผันแอนติบอดี m6A โดยเฉพาะ และจัดลำดับร่วมกับการจัดลำดับความละเอียดสูงรุ่นที่สองเพื่อตรวจหาตำแหน่งมีธิเลชันในทรานสคริปโตมทั้งหมด